تم تأسيس المعمل المركزى للرصد البيئى وتجهيزه بالأجهزة والمعدات عام 1996 وذلك من خلال منحة من الحكومة اليابانية .تم بناء قدرات العاملين بالمعمل المركزى فى مجال الرصد البيئى عن طريق جلب الخبراء اليابانيين إلى مصر وكذلك ايفاد العاملين للتدريب فى اليابان.
تم تقسيم المعمل المركزى حسب نوعية الرصد البيئى إلى أربعة إدارات مختلفة وهم:
مهام إدارة رصد المياه:
مهام إدارة رصد الهواء والضوضاء:
مهام إدارة رصد التربة والأرض: